Подлодка пропала в Атлантическом океане 15 ноября, когда возвращалась на базу в Мар-дель-Плата из Ушуайи. Незадолго до этого экипаж сообщил о поломке электрооборудования субмарины. На борту находились 44 человека, в штабе командования сообщили, что запасы кислорода на "Сан-Хуане" подходят к концу